Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Chd1P40201 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chd1P40201 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chd1P40201 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms