Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fen1P39749 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fen1P39749 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms