Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Traf1P39428 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Traf1P39428 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Traf1P39428 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Traf1P39428 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms