Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HmgclP38060 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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HmgclP38060 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HmgclP38060 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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