Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lig1P37913 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms