Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LdlrP35951 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LdlrP35951 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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