Protein–RNA interactions for Protein: P35436

Grin2a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2aP35436 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grin2aP35436 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2aP35436 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms