Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab23P35288 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab23P35288 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms