Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp12P34960 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms