Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxc5P32043 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms