Protein–RNA interactions for Protein: P31240

Pdgfb, Platelet-derived growth factor subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfbP31240 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfbP31240 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PdgfbP31240 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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