Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ctnnd1P30999 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ctnnd1P30999 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms