Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PtprmP28828 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprmP28828 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PtprmP28828 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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