Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Psmb9P28076 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Psmb9P28076 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Psmb9P28076 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Psmb9P28076 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms