Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vav1P27870 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vav1P27870 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms