Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChgaP26339 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChgaP26339 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChgaP26339 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChgaP26339 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChgaP26339 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ChgaP26339 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ChgaP26339 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms