Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk11bP24788 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms