Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pou3f1P21952 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pou3f1P21952 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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