Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BdnfP21237 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BdnfP21237 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BdnfP21237 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms