Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms