Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18533 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18533 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18533 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18533 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18533 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
P18533 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms