Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cxcl9P18340 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms