Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PtpraP18052 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PtpraP18052 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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