Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rag1P15919 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rag1P15919 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms