Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dnmt1P13864 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnmt1P13864 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms