Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Vpreb1P13372 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Vpreb1P13372 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms