Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FosbP13346 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FosbP13346 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FosbP13346 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FosbP13346 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FosbP13346 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FosbP13346 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FosbP13346 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms