Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cntn1P12960 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cntn1P12960 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms