Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm9520-201ENSMUST00000209460 1253 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Chrm1P12657 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms