Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PolP11369 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PolP11369 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PolP11369 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PolP11369 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolP11369 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolP11369 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms