Protein–RNA interactions for Protein: P10923

Spp1, Osteopontin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spp1P10923 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Spp1P10923 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Spp1P10923 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms