Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prf1P10820 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prf1P10820 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms