Protein–RNA interactions for Protein: P09925

Surf1, Surfeit locus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf1P09925 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Surf1P09925 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Surf1P09925 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms