Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itgb1P09055 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itgb1P09055 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms