Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NefmP08553 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NefmP08553 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NefmP08553 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefmP08553 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefmP08553 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefmP08553 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefmP08553 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefmP08553 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NefmP08553 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NefmP08553 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NefmP08553 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms