Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Egr1P08046 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Egr1P08046 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms