Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-Ab1P01921 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-Ab1P01921 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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H2-Ab1P01921 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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H2-Ab1P01921 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
H2-Ab1P01921 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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