Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01823 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01823 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01823 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
P01823 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms