Protein–RNA interactions for Protein: P01810

Ig heavy chain V region J539, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01810 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01810 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01810 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01810 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01810 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01810 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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