Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01735 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01735 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01735 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01735 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01735 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01735 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01735 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01735 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01735 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P01735 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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