Protein–RNA interactions for Protein: P01673

Ig kappa chain V-III region PC 2485/PC 4039, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01673 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01673 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01673 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01673 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01673 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01673 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01673 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms