Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01648 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01648 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01648 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01648 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01648 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01648 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01648 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01648 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01648 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01648 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01648 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms