Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01641 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01641 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01641 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01641 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01641 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms