Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ShdO88834 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ShdO88834 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ShdO88834 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ShdO88834 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ShdO88834 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ShdO88834 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ShdO88834 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ShdO88834 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ShdO88834 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ShdO88834 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ShdO88834 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ShdO88834 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms