Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CntfrO88507 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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