Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vamp4O70480 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp4O70480 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms