Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SfnO70456 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SfnO70456 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SfnO70456 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SfnO70456 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SfnO70456 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SfnO70456 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SfnO70456 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SfnO70456 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SfnO70456 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SfnO70456 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms