Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Chrna4O70174 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chrna4O70174 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms