Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AurkbO70126 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
AurkbO70126 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms