Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PrxO55103 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PrxO55103 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PrxO55103 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PrxO55103 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PrxO55103 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrxO55103 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrxO55103 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrxO55103 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrxO55103 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrxO55103 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrxO55103 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrxO55103 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms